Khoa Huyết học - Truyền máu được thành lập năm 1981. Hàng năm thực hiện hơn 600.000 lượt xét nghiệm huyết học, đông máu, miễn dịch - huyết học và Virus.Tổ chức vận động, tuyền truyền Hiến máu tình nguyện, tiếp nhận máu, điều chế các chế phẩm máu (Hồng cầu khối, Huyết tương/Huyết tương tươi đông lạnh, Huyết tương tươi giàu tiểu cầu, Tiểu cầu Pool...), Lưu trữ và cung cấp máu. Hàng năm cung cấp hơn 2.300 lít máu và chế phẩm máu. Tỷ lệ máu tình nguyện đạt 100 %. Tỷ lệ sử dụng chế phẩm máu đạt trên 100 %.

Khoa chẩn đoán hình ảnh là cơ sở thực hiện các kĩ thuật tạo ảnh y học để chẩn đoán bệnh và theo dõi kết quả điều trị, bằng các thiết bị X-quang, siêu âm, cộng hưởng từ…có các hệ thống máy hiện đại như: 1 Hệ thống chụp mạch số hóa xóa nền (DSA); 1 máy chụp X- quang tuyến vú; 2 dàn máy chụp cộng hưởng từ (MRI) 1,5 Tesla; 1 máy chụp cắt lớp vi tính (CT) 256 lát;1 máy chụp cắt lớp vi tính (CT) 128 lát; 2 máy chụp CT đa lát; 1 máy chụp CT đơn lát; 1 máy chụp X-quang số hóa; 4 máy chụp X-quang thường quy; 6 máy siêu âm các loại...Hàng năm khoa thực hiện trung bình 125 000 lượt chụp X-quang; 14 500 lượt chụp CT các loại; 3500 lượt chụp MRI; 100 000 lượt siêu âm các loại...

Khoa Dược mỗi năm cung cấp trên 50 tỷ tiền thuốc, hoá chất phục vụ công tác khám và điều trị cho bệnh viện, trong đó chú trọng tăng dần tỷ lệ thuốc nội (44%), đảm bảo cung cấp đầy đủ, kịp thời thuốc có chất lượng. Hoạt động của Nhà thuốc ổn định hàng năm góp vào quỹ bệnh viện 1,5 tỷ đồng. Từ năm 2013, hoạt động Dược lâm sàng được đẩy mạnh góp phần tư vấn, giám sát sử dụng thuốc an toàn, hợp lý. Năm 2016, thực hiện pha chế thuốc điều trị ung thư tại tủ pha chế phân lập vô trùng HPI đảm bảo an toàn cho người bệnh, người thực hiện và môi trường.

Khoa Giải phẫu bệnh được thành lập năm 1981, mỗi năm xét nghiệm cho trên 38.000 lượt bệnh nhân khám và xét nghiệm chuyên ngành Giải phẫu bệnh. Khoa gồm có 3 bộ phận: Xét nghiệm tế bào học; Xét nghiệm Mô bệnh học; và Nhà đại thể.

Khoa Hóa sinh được trang bị các thiết bị phân tích hiện đại gồm: máy xét nghiệm hóa sinh tự động, máy xét nghiệm sinh học phân tử, máy xét nghiệm miễn dịch điện hóa phát quang tự động, máy xét nghiệm nước tiểu, máy phân tích khí trong máu và máy xét nghiệm điện giải đồ. Cùng với hệ thống thiết bị hiện đại, khoa còn có đội ngũ cán bộ khoa học chuyên sâu và kỹ thuật viên lành nghề để thực hiện các các xét nghiệm Real - time - PCR, Hóa sinh máu, Hóa sinh miễn dịch, Hóa sinh nước tiểu, … với chất lượng đạt tiêu chuẩn ISO 15189:2012, đáp ứng nhu cầu ngày càng cao của lâm sàng cũng như của người bệnh. Hàng năm có khoảng 250.000-300.000 lượt bệnh phẩn xét nghiệm tại khoa với trên 1,5 triệu test xét nghiệm/năm.

Khoa Vi sinh là đơn vị xét nghiệm chuyên sâu, thực hiện các xét nghiệm vi sinh vật gây bệnh ở người và giám sát vi khuẩn kháng thuốc trong bệnh viện; tư vấn cho lâm sàng sử dụng thuốc kháng sinh hợp lý, an toàn và hiệu quả; đào tạo về xét nghiệm Vi sinh cho nhân viên y tế và sinh viên các trường đại học, cao đẳng.

Khoa Kiểm soát nhiễm khuẩn được thành lập năm 2008 với nhiệm vụ giám sát phòng ngừa kiểm soát nhiễm khuẩn của bệnh viện, quản lý chất thải y tế...

Khoa Dinh dưỡng là khoa phục vụ các chế độ dinh dưỡng trong toàn bệnh viện, đặc biệt là có các chế độ ăn cho bệnh lý. Hàng năm khoa phục vụ được khoảng 180.000 suất ăn dinh dưỡng bệnh lý cho người bệnh, 80.000 suất ăn trực cho nhân viên y tế và phục vụ hàng trăm nghìn suất ăn tại căng tin. Bên cạnh đó khoa còn tư vấn cho người bệnh về chế độ ăn cho bệnh lý khoảng 800 - 1000 lượt người bệnh.